一、浅谈中国驯鹿种群(论文文献综述)
刘伟石,马希祥,田晓瑞,盖广辉,王庆海,吴晓宇,李和平[1](2021)在《引进芬兰驯鹿体尺指标的测定》文中研究说明为了了解芬兰驯鹿体尺数据,试验在内蒙古大兴安岭林管局根河林业局所辖林场对引进芬兰驯鹿的体长、体高、胸围、管围等9个体尺指标进行了测定,并以测定数据为基础进一步计算了体长指数、胸围指数、管围指数、体躯指数4个重要的体尺指数。结果表明:雌性、雄性驯鹿的体长、体高、胸围、管围分别是(96.0±0.8) cm、(91.0±2.2) cm、(125.7±4.9) cm、(13.0±1.8) cm和(109.2±5.1) cm、(106.0±3.8) cm、(130.0±5.2) cm、(14.9±1.1) cm;雌性、雄性驯鹿的体长指数、胸围指数、管围指数、体躯指数分别是(105.54±1.71)%、(138.06±2.75)%、(14.27±0.59)%、(130.87±4.02)%和(103.09±4.54)%、(122.76±6.05)%、(14.04±0.85)%、(119.33±8.02)%。从体尺指数结果看,驯鹿体型属于挽用型结构,与驯鹿作为役用工具的客观事实相符合。
张晶钰,张慧敏,李鸿屹,雷林,韩松霖,李和平[2](2020)在《中国北方驯鹿生物多样性研究与疾病概述》文中研究说明驯鹿(Rangifer tarandus)是耐寒能力极高的极地动物,目前处于一种野生或半驯化状态,其广泛分布在环极地区,我国大兴安岭鄂温克猎民分布区有人工饲养种群。驯鹿是高寒地区人类的重要伴侣动物和经济动物,具有巨大的文化和经济价值。近年来,气候剧烈变化,食物减少,以及某些寄生虫导致的疾病,使驯鹿的生活周期发生改变,种群数量不断减少。目前对驯鹿的研究主要集中在生物多样性保护、寒冷耐受、遗传适应性和后基因组学等领域。文章综述了驯鹿生物学特征和种群多样性现状,并对国外近年来的驯鹿高发疾病进行了综述,以期为科学制订驯鹿的保护措施及哺乳动物的驯化过程提供理论基础。
毕晓丹[3](2020)在《雌雄驯鹿茸顶端间充质组织基因转录及表达差异分析》文中进行了进一步梳理驯鹿(Rangifer tarandus)广泛分布于环北极圈地带的寒带动物,在我国,驯鹿仅分布在大兴安岭西北部,由鄂温克猎民所驯养。鹿茸是哺乳动物中唯一能够完全而循环再生的器官,并且无癌变迹象的快速生长发育,可以作为人类医学领域开展创伤修复、器官再生和肿瘤等研究的独特动物模型。鹿茸通常是雄性鹿科动物的特征,而驯鹿则是雌、雄都能生茸的鹿科动物。驯鹿的雌、雄鹿茸之间,以及其与其它雄性鹿科动物鹿茸之间有诸多明显的表观差异,比如分支大小、数量、粗细、复杂程度及再生脱落时间等。因此,从分子调控机理上探究、阐明这些表观差异的内在分子机制,已经是科学界极富挑战力的焦点科学问题,也是有别于仅以其它鹿科动物雄性为研究对象的、更具新颖性的独特研究领域。本研究针对人们对雌、雄驯鹿均生茸的内在分子机制了解十分匮乏的有关科学问题选题,以成年健康雌雄驯鹿茸生长旺期的顶端间充质组织为试验材料,从转录组学角度利用Illumina高通量测序平台,对雌、雄性驯鹿茸进行RNA-Seq,同时用De novo组装的方法获得驯鹿茸Unigene库,并将Unigenes序列与Nr、Swissprot、GO、COG、KOG、Pfam、KEGG等数据库比对进行基因的功能和结构注释,在分子水平上揭示雌雄性驯鹿茸顶端间充质组织基因转录及表达差异的内在调控机制。研究结果表明:1.通过对雌、雄性驯鹿茸顶端间充质组织的cDNA文库进行转录组测序,获得转录组原始数据,并存储于NCBI SRY数据库中,登录号:SRR9051566和SRR9051567。经过数据过滤处理,获得了高质量的洁净序列数据18.86 GB,各样品Q30碱基百分比均不小于88.73%。利用Trinity软件进行序列的从头组装,获得了驯鹿茸间充质组织的转录本和Unigenes,转录本和Unigenes数量分别为124,139和94,575条;N50长度分别为1,768 nt和1,193nt;平均长度分别911.36 nt和704.69nt。2.通过比对生物数据库,共注释到30,980个基因;序列注释结果显示与牛属普通牛的匹配序列百分比最高,为(Bos taurus)18.63%,其它属种注释如下:水牛12.83%、牦牛8.55%、藏羚羊8.13%、山羊6.47%、美洲野牛6.14%、绵羊6.08%、野猪2.23%、野骆驼1.52%、抹香鲸1.36%、其它28.06%。GO功能分类结果显示,14,618个基因归属于60个功能组,转录水平调节对鹿茸快速生长起重要的调控作用。COG和KOG功能分类结果显示驯鹿茸生长发育过程中大量基因参与到蛋白质合成、信号传递、转录等细胞活动中,说明生长因子、转录因子等功能蛋白与鹿茸的快速生长发育密切相关。在292个KEGG通路中共注释到15,167个基因,其中2条癌症通路,4条信号转导通路,3条蛋白质合成活动相关通路注释到较多的基因,显示出驯鹿茸间充质组织的类癌样生长,以及活跃的蛋白质合成过程。3.通过功能注释共筛选出与生长发育过程密切相关的22个生长因子、22个生长因体受体,77个转录因子,其中包括7个转录因子家族。生长因子和受体的大量发现说明生长因子通过和受体的相互作用传递细胞生长信号,参与驯鹿茸间充质组织生长发育过程。转录因子家族成员的大量发现表明转录因子对驯鹿茸间充质组织的生长具有广泛的调节作用。Fox、SOX、E2F转录因子家族成员之间的结构分析显示了家族内成员的共同祖先起源,各转录因子家族对驯鹿茸间充质组织生长发育的调控作用与其结构有关。驯鹿茸间充质组织中含有大量的SSR(7,480个)位点和SNP(雌、雄性分别82,226和84,435个)位点。4.通过计算基因的表达量,筛选出30个在驯鹿茸间充质组织内高表达的基因,包括8个编码信号转导机制相关蛋白的基因CDKN1B、CDKN1C、PTN、GJA1、TGFB1、IHH、MDK、ENG,其中包含4个肿瘤抑制因子;5个转录因子基因ATF4、AP-1、RUNX2、DLX5、SOX-9;17个细胞外基质蛋白基因,包括TNN、COL5A1、LGALS1、COL2A1、COL6A1、COL6A3、COL5A2、IBSP、OPN、COL9A2、COL18A1、COL15A1、WISP1、COL27A1、COL3A1、COL13A、COL4A1,这些基因与驯鹿茸间充质组织细胞的增殖、分化、细胞周期控制等活动相关。30个高表达基因的蛋白质相互作用分析结果显示信号转导机制相关蛋白与转录因子共表达,说明转录因子可能通过响应信号转导机制相关蛋白传递的细胞生长信号调控相关基因的表达,参与驯鹿茸间充质组织的生长发育过程。5.通过差异表达基因分析,共筛选出649个差异表达的基因。GO功能富集分析显示差异基因富集在细胞外空间、核糖体结构组成以及翻译等功能。KEGG通路富集分析显示差异基因富集在2条癌症通路,7条信号通路,以及细胞粘附通路等。在筛选出的32个差异表达的基因中,与软骨形成相关的基因显着下调,与细胞粘附相关的基因显着上调,说明雌、雄性驯鹿茸间充质组织的软骨形成进程和细胞粘附状态存在差异。蛋白质互作网络分析显示BMP4等10个基因对雌、雄驯鹿茸软骨化进程差异起重要的作用。RT-qPCR基因表达水平定量验证结果与转录组基因表达量计算结果基本一致。本研究对雌、雄性驯鹿茸顶端间充质组织基因转录及表达差异进行的分析所取得的研究结果,对在分子水平了解驯鹿茸生长过程中的基因结构、功能、信号传递以及雌雄性驯鹿茸生长过程的调控差异具有积极的科学意义。
王晟楠[4](2020)在《鹿科动物胃内微生物菌群结构及其功能分析》文中认为近年来,随着动物消化系统微生物菌群结构研究的深入,宿主及其消化系统内微生物菌群间协同进化关系正逐步被认知。鹿科动物胃内微生物菌群结构在与其长期协同进化过程中,不断影响其采食行为与食物结构,促使鹿科动物形成了可分解高纤维物质的消化系统,进化出具有特殊膨大的腔体器官和独特的生理结构,来满足复杂的微生物所需的生长环境。但其4个胃内微生物菌群结构及其相互间互作关系与功能,以及差异性是否可以反映出鹿种间系统发育关系仍不清楚。本研究采用高通量测序技术与组织学分析等,对梅花鹿、马鹿、驯鹿、白唇鹿、狍五种鹿科动物的瘤胃、网胃、瓣胃、皱胃内的微生物菌群进行测序,以探索:1)对五种鹿科动物4个胃内细菌、古菌、真菌三大微生物菌群组成结构全面解析,澄清各胃内微生物菌群组成结构。2)通过对比五种鹿科动物胃内微生物菌群差异,尝试探索鹿种耐高海拔或耐寒适应性与胃内微生物菌群关系。3)对比不同鹿种各胃内微生物菌群差异,尝试解析其功能,通过代谢通路功能预测,探究微生物菌群在不同鹿胃内参与分解代谢过程中的功能差异性。4)尝试通过解析胃内微生物菌群差异,探究其与鹿种间系统发育的关系。研究结果表明:1 细菌梅花鹿、驯鹿、白唇鹿、马鹿、狍胃内细菌共发现21个门,分别隶属于17、18、20、19、15个门,且厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)为优势菌门。除优势菌门外,五种鹿4个胃中,梅花鹿皱胃的放线菌门(Actinobacteria)丰度占比高达23.47%,远高于其他胃,同时也远高于其他鹿;瓣胃、皱胃的变形菌门(Proteobacteria)丰度占比(1.56%、3.84%)高于瘤胃和网胃(0.29%、0.4%);驯鹿皱胃的变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、柔型菌门(Tenericutes)丰度占比分别是 10.17%、6.51%、1.4%,均高于其他胃,其中柔型菌门(Tenericutes)丰度占比为五种鹿最高,瓣胃的TM7丰度占比仅0.73%,低于其他胃;白唇鹿皱胃的放线菌门丰度占比高达11.95%,而其他胃均低于1%,各胃内TM7丰度占比依次增加至皱胃最高(1.83%),瘤胃和网胃的SR1丰度占比分别为1.78%和1.76%高于瓣胃和皱胃;马鹿皱胃的变形菌门丰度占比最高(12.26%)、瓣胃中次之(3.86%),放线菌门丰度占比(12.05%)也高于其他胃;狍除优势菌门和皱胃内的变形菌门(丰度占比1.21%)外,其他菌门在各胃中的丰度占比均较低。厚壁菌门与拟杆菌门在不同鹿种各胃内的丰度占比比例(F/B)分析结果显示,驯鹿、白唇鹿和狍的F/B远高于梅花鹿、马鹿,这意味着梅花鹿和马鹿机体沉积脂肪的能力低于驯鹿、白唇鹿和狍,而在植物中获得多糖的能力高于驯鹿、白唇鹿和狍。白唇鹿和驯鹿F/B比值高于其他鹿,可能是白唇鹿适应高海拔和驯鹿适应低温环境的原因之一。梅花鹿、驯鹿、白唇鹿、马鹿、狍胃内细菌的属水平上共注释到172个属,其中平均丰度占比高于1%有13个属,平均丰度占比高于0.1%的有58个属;按丰度占比高低,依次为普雷沃菌属(Prevotella,丰度占比10.10%)、琥珀酸菌属(Succiniclasticum,丰度占比3.40%)、瘤胃球菌属(Ruminococcus,丰度占比3.00%)、粪球菌属(Coprococcus,丰度占比1.50%)、丁酸弧菌属(Butyrivibrio,丰度占比1.20%)。梅花鹿、驯鹿、白唇鹿、马鹿、狍胃内的特有菌属分别是5、6、3、4、10个。梅花鹿、驯鹿胃内细菌多样性和丰度最高,马鹿最低。狍的细菌菌群结构与其他鹿种相差最远,驯鹿次远,马鹿与白唇鹿最为相似。梅花鹿瘤胃、网胃中菌群多样性和丰度高于其他鹿种;白唇鹿和梅花鹿瓣胃中多样性最高;狍皱胃中多样性最高。本研究发现瘤胃、网胃、瓣胃的细菌菌群组成结构相似,且细菌丰度和多样性高于皱胃,这意味着瘤胃、网胃、瓣胃的结构可能更适宜菌群生长。本研究在驯鹿胃内并未发现已报道的北极地区驯鹿胃内可分解地衣中毒性松萝酸的菌群,这表明我国驯鹿胃内分解地衣松萝酸的微生物菌群与北极地区驯鹿存在差异。2古菌梅花鹿、驯鹿、白唇鹿、马鹿、狍胃内古菌共发现2个门,在五种鹿胃内均有发现;广古菌门(Euryarchaeota)在五种鹿胃内丰度占比均高达99%,为绝对优势菌门。梅花鹿皱胃的泉古菌门(Crenarchaeota,丰度占比为0.2%),高于其他鹿。梅花鹿、驯鹿、白唇鹿、马鹿、狍胃内古菌的属水平上共注释到49个属,其中平均丰度占比高于1%有4个属。甲烷短杆菌属(Methanobrevibacter)丰度占比最高,为绝对优势属,平均丰度占比超过93%;其在马鹿4个胃的平均丰度占比最高,为98.51%;在驯鹿胃的丰度占比97.39%,白唇鹿胃的丰度占比96.94%,梅花鹿胃的丰度占比96.8%;狍胃的丰度占比最低,仅为79.30%。其余丰度占比超过1%的菌属有:驯鹿、白唇鹿和马鹿胃内发现的甲烷盘菌属(Methanoplanus),且其仅在马鹿皱胃中丰度占比超过1%,为1.41%;马鹿网胃的甲烷微球菌属(Methanimicrococcus,丰度占比1.44%),在狍胃内未发现;狍胃的甲烷球形菌属(Methanosphaera)在瘤胃、网胃的丰度占比最高(丰度占比32.74%、24.85%)。其他丰度占比低于0.1%的菌属中,盐红菌属(Halorubrum)为梅花鹿瘤胃的特有菌属;SAGMEG-1为狍网胃的特有菌属。甲烷囊菌属(Methanoculleus)、嗜盐碱单孢菌属(Natronomonas)、Thermogymnomonas仅在梅花鹿和狍胃内被发现;Nitrosopumilus仅在梅花鹿皱胃和驯鹿网胃内被发现;CandidatusNitrososphaera、甲烷杆菌属(Methanobacterium)、vadinCA11仅白唇鹿胃内未被发现;甲烷绳菌属(Methanolinea)仅在狍胃中未被发现;甲烷丝状菌属(Methanosaeta)在五种鹿胃内均有分布,但在马鹿皱胃的丰度占比高于其他胃;甲烷八叠球菌属(Methanosarcina)在梅花鹿和狍的4个胃内分布平均,且丰度占比高于其他鹿。胃内古菌菌群丰度和多样性对比发现,白唇鹿高于梅花鹿、驯鹿、马鹿,并明显高于狍。狍胃内古菌菌群结构与其他四种鹿相差最远,驯鹿次远,梅花鹿与白唇鹿最为相似。除梅花鹿皱胃中古菌菌群多样性略高于白唇鹿外,白唇鹿4个胃内古菌菌群丰度和多样性均高于其他鹿种。狍的4个胃内古菌菌群丰度和多样性均低于其他鹿种。这表示在产甲烷方面狍甲烷产量最小,白唇鹿最高。而五种鹿中狍胃体积最小,这进一步印证了甲烷产量可能与反刍动物胃体积有关的观点。对共有OTU的分析得出鹿科动物大部分产甲烷古菌在网胃中丰度占比最高,印证了鹿科动物甲烷主要在网胃中产生的观点3真菌梅花鹿、驯鹿、白唇鹿、马鹿、狍胃内真菌共发现15个门,分别隶属于10、10、9、11、11个门。子囊菌门(Ascomycota)为绝对优势菌门。胃内其他丰度占比高于1%的菌门有14个,担子菌门(Basidiomycota)在梅花鹿瓣胃、驯鹿网胃、白唇鹿皱胃、马鹿瓣胃、狍皱胃内丰度占比最高(丰度占比分别为5.97%、6.39%、2.96%、10.54%、4.14%);驯鹿网胃的毛霉门(Mucoromycota)丰度占比超过1%为1.29%。其他低于1%的菌门中,Aphelidiomycota是驯鹿瘤胃内特有菌。蛙粪霉门(Basidiobolomycota)、梳霉门(Kickxellomycota)分别是马鹿瘤胃和皱胃内特有菌门;芽枝霉门(Blastocladiomycota)仅在梅花鹿皱胃和狍瘤胃内被发现;根肿黑粉菌门(Entorrhizomycota)、捕虫霉门(Zoopagomycota)分别是狍瘤胃和网胃的特有菌门;壶菌门(Chytridiomycota)在梅花鹿和驯鹿的胃内平均丰度占比高于其他鹿;球囊菌门(Glomeromycota)在梅花鹿4个胃内均匀分布,且平均丰度占比高于其他鹿;球囊菌门(Glomeromycota)、被孢霉门(Mortierellomycota)、油壶菌门(Olpidiomycota)、隐真菌门(Rozellomycota)在本研究的五种鹿的4个胃内均有分布,且丰度占比均匀。梅花鹿、驯鹿、白唇鹿、马鹿、狍胃内真菌的属水平上共注释到632个属,其中丰度占比超过1%的共有23个,梅花鹿6个、驯鹿6个,白唇鹿2个,马鹿8个,狍6个。不同鹿科动物胃内真菌属水平结构具有较大差异。在梅花鹿胃内,念珠菌属(Candida,丰度占比6.09%)在梅花鹿瘤胃内丰度占比最高;网胃的伊萨酵母菌属(Issatchenkia)和毕赤酵母菌属(Pichia)为绝对优势菌属,丰度占比最高(分别为18.04%、16.41%);瓣胃的腐质霉菌属(Humicola,丰度占比1.25%)、Hannaella(丰度占比1.57%),高于其他胃;皱胃的Diutina,丰度占比3.02%,高于其他鹿。驯鹿胃内的Evernia、青霉菌属(Penicillium)、黄丝曲霉菌属(Talaromyces)、Thelebolus仅在驯鹿胃中丰度占比大于1%;驯鹿胃的异多棒菌属(Xenopolyscyalum)是驯鹿特有菌属,在瘤胃和网胃丰度占比大于1%(分别为1.44%、1.39%);驯鹿网胃的Cutaneotrichosporon,(丰度占比1.98%),高于其他胃;瓣胃的光黑壳菌属(Preussia,丰度占比15.2%),高于其他胃。白唇鹿胃内高于1%的优势菌属有2个,瓣胃的伊萨酵母属(Issatchenkia,丰度占比27.12%)和Diutina,丰度占比1.23%,高于其他胃。马鹿胃内丰度占比高于1%的优势菌属中,马鹿瘤胃的念珠菌属(Candida)、伞壳菌属(Eleutheromyces)、Ophiognomonia(分别丰度占比6.16%、3.51%、1.74%),高于其他胃;马鹿网胃的壳针孢属(Septoria,丰度占比20.83%),高于其他胃;瓣胃的Cutaneotrichosporon(丰度占比1.34%)、Hannaella(丰度占比1.58%),高于其他胃;马鹿皱胃的Papiliotrema和毛孢子菌属(Trichosporon)(丰度占比2.8%、1.84%),高于其他胃。狍胃内高于1%的优势菌属中,瘤胃的球腔菌属(Mycosphaerella,丰度占比6.68%),高于其他胃;网胃的Boeremia、柱隔孢属(Ramularia)、光黑壳菌属(Preussia)丰度占比分别为1.43%、8.2%、2.01%,高于其他胃;狍瓣胃的Ophiognomonia丰度占比5.43%,高于其他胃;壳针孢属(Septoria)为狍胃内绝对优势属,在皱胃内丰度占比43.65%,高于其他胃。其他丰度占比高于0.1%的菌属中,冰岛衣属(Cetraria)、石蕊属(Cladonia)、Cryptodiscus、扁枝衣属(Evernia)、Hormonema、Kalmusia、亚黑团孢属(Periconiella)、叉丝单囊壳属(Podosphaera)、柱顶孢霉属(Scytalidium)、Xenochalara是驯鹿胃内特有菌属;嗜杀酵母(Cyberlindnera)是梅花鹿特有菌属;枝梗鞭菌属(Cyllamyces)是白唇鹿特有菌属;Mycodiella、月盾霉属(Peltaster)是狍特有菌属;支顶孢属(Acremonium)、Alternaria、古根菌属(Archaeorhizomyces)、亚隔孢壳属(Didymella)、附球菌属(Epicoccum)、蜡蚧菌属(Lecanicillium)、被孢霉属(Mortierella)、青霉属(Penicillium)、织孢霉属(Plectosphaerella)、Saitozyma、Simplicillium、Tausonia普遍存于本研究的五种鹿科动物的4个胃中。虽然子囊菌门和担子菌门是鹿科动物胃内优势菌门,但本研究中五种鹿科动物胃内真菌菌群结构组成上差异较大。不同鹿种因所在地域不同,为适应长期生长环境而演化产生不同的胃内菌群结构,我们的研究认为,真菌菌群组成结构受到生境适应性的影响可能最为明显。4 KEGG代谢通路胃内微生物菌群代谢通路中细菌菌群氨基酸代谢通路和碳水化合物代谢通路丰度最高;古菌菌群在碳水化合物代谢通路中丰度最高,其次为氨基酸代谢通路;真菌菌群生物合成一级通路中脂肪酸和脂质的生物合成通路明显高于其他通路。该现象表明在食物代谢过程中,真菌更多的参与脂肪酸和脂类代谢,细菌和古菌更多的参与氨基酸和碳水化合物代谢。此外,挥发性脂肪酸可调控前胃(包括瘤胃、网胃、瓣胃)上皮细胞生长。本研究发现鹿科动物前胃上皮细胞生长主要受普雷沃氏菌属、琥珀酸菌属、瘤胃球菌属、丁酸弧菌属、梭状杆菌属通过代谢途径产生挥发性脂肪酸调控。5协同进化结合不同鹿胃内细菌菌群、古菌菌群和真菌菌群的差异性比对研究,发现真菌菌群结构在五种鹿科动物胃内均具有明显差异,但其结构组成受生长环境适应性影响最为明显。而细菌和古菌在菌群结构和代谢通路功能基因方面,狍对比其他四种鹿均表现出极大的差异性。除狍外,驯鹿差异略大于其他三种鹿科动物;梅花鹿、马鹿和白唇鹿在细菌和古菌菌群结构和代谢通路的功能基因方面相似度较高。细菌与古菌菌群结构的差异程度与五种鹿科动物在属等级划分上呈现明显的对应性,其差异性可反映出鹿科动物属间的系统发育关系,也佐证了细菌与古菌菌群结构与鹿科动物之间协同进化密切相关。
殷亚杰,聂春雨,翟健程,张志国,刘伟石,李和平[5](2019)在《圈养驯鹿粪便中免疫球蛋白含量测定与相关性分析》文中提出为了研究圈养条件下驯鹿免疫生理状态,试验采用酶联免疫法对敖鲁古雅原始部落景区驯鹿粪便中免疫球蛋白A(IgA)、免疫球蛋白G(IgG)和免疫球蛋白M(IgM)的含量进行测定,并对不同年龄和不同性别驯鹿粪便中三种免疫球蛋白的含量及相关性进行了比较分析。结果表明:驯鹿粪便中IgA含量最高,其次是IgG和IgM;三种免疫球蛋白含量随年龄增长出现先升后降的变化趋势,IgA和IgG在各年龄组间的变化较明显;不同性别间,雌驯鹿粪便中IgA、IgG和IgM含量在不同年龄段均高于雄鹿,其中IgA含量在青年组和成年组雌、雄驯鹿间差异显着(P<0.05);驯鹿粪便中IgA和IgG之间呈极显着正相关(P<0.01),IgA与IgM、IgG与IgM之间相关性不显着(P>0.05)。说明粪便IgA可以作为探测驯鹿免疫生理状态的重要指标,为驯鹿圈养种群的监测和健康评价提供科学依据。
韩磊[6](2019)在《引进驯鹿种群的遗传结构及其多样性分析》文中提出驯鹿(Rangifr tarandus)是一种寒带动物,广泛分布于环北极圈地带。在我国,驯鹿分布于大兴安岭西北部,由鄂温克猎民所驯养。驯鹿是鄂温克民族使鹿部落文化的重要载体,也是根河旅游产业的重要品牌,具有较高的经济价值和极其重要的生态价值。由于人类活动的干扰,长期的近亲繁殖,粗放式的饲养管理,兽害及疾病的发生等,使种群数量一直徘徊在600头左右,因此我国驯鹿的生存状况与环境极其堪忧。针对此严峻状况,基于恢复和改善我国驯鹿种群的考虑,根河林业局在内蒙古自治区重大科技支撑项目的支持下,于2017年2月和2018年2月从芬兰引进驯鹿种群,旨在通过引进来改良国内驯鹿遗传品质,丰富群体遗传多样性,从根本上摆脱我国驯鹿种群的濒危状况。但由于引进驯鹿没有系谱,亲缘关系、群体遗传结构与多样性也不清楚。因此,为了全面的科学评价所引进驯鹿种群的遗传结构及其多样性,本研究利用线粒体DNA D-Loop序列以及微卫星技术分析了 129头引进驯鹿种群的遗传结构和遗传多样性,为今后合理利用所引进的驯鹿种群资源提供了科学参考,研究结果如下:1.从19个微卫星位点中筛选出14个扩增效果良好且高度多态的位点,共检测出128个等位基因,平均等位基因数为9.1429,平均观测杂合度(Ho)和期望杂合度(He)分别为0.4833和0.7121。在14个微卫星位点中有9个显着偏离Hardy-Weinberg(H-W)平衡,Ewens-Watterson中性检验显示所有位点的观测F值均在95%置信区间内且都大于0,均属于中性位点;2.测序得到引进驯鹿种群含473个核苷酸的线粒体DNA D-Loop序列,其核苷酸多样度(Pi)为0.01022,平均核苷酸差异数(k)为4.834。引进驯鹿种群中共存在9种单倍型,单倍型(基因)多样度(Hd)为0.611;3.通过邻接法(NJ)对引进驯鹿种群构建系统发育树发现,该种群个体间遗传距离分布范围在0-0.03之间,平均遗传距离为0.011。引进驯鹿种群总共聚为三个分支,c支个体数最多,其中2017年引进的29只个体中绝大多数聚在了 c分支;4.通过与现有国内驯鹿种群对比发现,引进驯鹿种群和中国驯鹿种群的进化关系较远,引进驯鹿种群的平均等位基因数和单倍型多样度(n=9.1;Hd=0.611)要高于国内驯鹿种群(n=7.7;Hd=0.468),但其多态信息含量(PIC=0.675)略低于国内驯鹿种群(PIC0.701)。
林航[7](2018)在《鄂温克族驯养驯鹿的本土知识》文中研究表明通过分析驯鹿的生物属性和鄂温克族驯养驯鹿的历史发展脉络,梳理具有鄂温克族特色的驯鹿驯养技术体系,从而关注鄂温克族驯养驯鹿的本土知识。结合2011年春对内蒙古根河敖鲁古雅鄂温克民族乡的探访调查,解析鄂温克对驯鹿生物特性的认知和文化涵义的理解,特别对1993年生态移民搬迁前后出现的变化分析,进而探讨鄂温克驯养驯鹿的当代变迁和对当地生态文明建设的潜在影响。
翟健程[8](2019)在《雌雄驯鹿和梅花鹿茸顶端组织生长调控相关基因DNA甲基化水平差异研究》文中提出鹿茸是哺乳动物中惟一能够完全再生的器官,且能够无癌变迹象的快速增殖生长,是人类医学领域开展创伤修复、器官再生和肿瘤等研究的独特模型。鹿茸通常是鹿科动物雄性的特征,而驯鹿则是雌、雄都能生茸的鹿科动物。驯鹿的雌、雄鹿茸之间,以及其与其他鹿科动物雄性鹿茸之间有诸多明显的表观差异,比如分支大小、数量、粗细、复杂程度及再生脱落时间等。从遗传上探究、阐明这些表观差异的内在分子机制,已经是科学界极富挑战力的焦点科学问题。参与调控鹿茸生长发育的基因正在被逐一发现,其调控机制与功能也在被逐步揭示,这为进一步研究这些基因在“同一鹿种鹿茸组织与其他组织、不同鹿种鹿茸组织、雌雄鹿茸组织(仅驯鹿)”的调控与表达差异奠定了基础。DNA甲基化作为一种重要的表观遗传机制,可以通过调控目标基因的转录和表达,在生命过程中起到重要调控作用。因此,从分析鹿茸DNA甲基化的角度入手,研究DNA甲基化差异,将对在分子水平阐明驯鹿的雌、雄鹿茸之间,以及其与梅花鹿等其他鹿科动物鹿茸之间表观遗传机制上的差异具有重要科学价值和意义。本研究以同龄健康的成年雌雄驯鹿和梅花鹿为研究对象,以雌雄驯鹿、梅花鹿茸顶端间充质及血液组织为试验材料,选取10个与鹿茸生长调控相关并极有可能直接导致表观遗传差异的基因(COL1A1、COL6A3、DKK1、IGF1、KGF、NGF、OPN、RUNX1、S100A4、STAT1),对其启动子区进行克隆及生物信息学分析,在此基础上利用BSP技术研究10个基因在雌雄驯鹿、梅花鹿的鹿茸顶端间充质及其血液组织的DNA甲基化模式,进而分析在不同组织间的DNA甲基化差异并探究其所致表观差异的调控机理,研究结果如下:1、成功克隆得到驯鹿源、梅花鹿源的10个鹿茸相关基因部分启动子序列,且与白尾鹿的同源性均达到98.3%以上,并与牛、羊等偶蹄目动物也有较高同源性(85.8%以上),都具有核心启动子元件、CpG岛和核心启动子区域或位点等启动子的典型特征。2、10个基因在相同组织、同一基因在不同组织中都有不同的DNA甲基化模式,甲基化率(0.00±0.00)%~(91.70±1.39)%。COL6A3、NGF、OPN、S100A4 基因在各组织都发生不同程度的DNA甲基化,COL6A3基因在血液组织的甲基化率最高[(73.50±0.75)%~(83.53±2.99)%]。COL1A1、DKK1、IGF1、KGF、RUNX1、STAT1 基因并非在所有组织都发生DNA甲基化,如KGF基因在雄性驯鹿和梅花鹿茸甲基化率分别为(45.53±3.87)%、(42.20±1.91)%,而在雌性驯鹿茸未发生DNA甲基化;RUNX1基因则只在雌性驯鹿茸中发生低水平的DNA甲基化[(3.33±1.44)%]。3、在10个基因启动子序列的CpG二核苷酸位点的DNA甲基化模式中,不同基因的甲基化受到各自基因启动子序列中CpG二核苷酸位点甲基化程度的影响;而同一基因启动子区在不同组织的DNA甲基化模式受到CpG二核苷酸位点甲基化差异的影响。4、比较分析雌性驯鹿、雄性驯鹿、梅花鹿的鹿茸顶端间充质及其血液组织的DNA甲基化差异发现:雌、雄驯鹿茸顶端间充质组织:(1)雌性在COL6A3、NGF、OPN、RUNX1、S100A4基因的甲基化率显着高于雄性(P<0.05),其在雌、雄性的甲基化率分别是(16.83±1.10)%、(6.63±1.31)%,(33.90±3.57)%、(17.20±3.57)%,(36.83±5.86)%、(18.10±0.87)%,(3.33±1.44)%、(0.00±0.00)%,(27.80±1.28)%、(21.67±2.17)%;(2)雌性在 IGF1、KGF 基因的甲基化率显着低于雄性(P<0.05),其在雌、雄性的甲基化率分别是(6.40±0.52)%、(7.20±1.28)%,(0.00±0.00)%、(45.53±3.87)%;(3)雌、雄性驯鹿在COL1A1基因均未发生甲基化,在其它2个基因的甲基化率无显着性差异(P>0.05)。驯鹿、梅花鹿茸顶端间充质组织:(1)雌性驯鹿在COL6A3、NGF、RUNX1、S100A4基因的甲基化率显着高于梅花鹿(P<0.05),而在KGF基因的甲基化率显着低于梅花鹿(P<0.05),其在雌性驯鹿、梅花鹿的甲基化率分别是(16.83±1.10)%、(7.10±1.93)%,(33.90±3.57)%、(21.57±1.21)%,(3.33±1.44)%、(0.00±0.00)%,(27.80±1.28)%、(5.03±1.44)%,(0.00±0.00)%、(42.20±1.91)%;(2)雄性驯鹿在 IGF1、KGF、S100A4 基因的甲基化率显着高于梅花鹿(P<0.05),在COL1A1、NGF、OPN基因的甲基化率显着低于梅花鹿(P<0.05),而在RUNX1基因均未发生甲基化,其在雄性驯鹿、梅花鹿的甲基化率分别是(2.23±0.92)%、(0.00±0.00)%,(91.70±1.39)%、(90.30±0.52)%,(21.67±2.17)%、(5.03± 1.44)%,(0.00±0.00)%、(2.40±0.00)%,(17.20±3.57)%、(21.57±1.21)%,(18.10±0.87)%、(35.70±1.40)%,(0.00±0.00)%、(0.00±0.00)%。在其余基因的甲基化率无显着性差异(P>0.05)。雌、雄驯鹿血液组织:(1)雌性在COL6A3、OPN基因的甲基化率显着高于雄性(P<0.05),在COL1A1、KGF、S100A4基因的甲基化率显着低于雄性(P<0.05),其在雌、雄性的甲基化率分别是(83.53±2.99)%、(77.10±4.03)%,(80.00±1.40)%、(52.40±0.87)%,(3.47±0.61)%、(6.40±0.00)%,(86.70±0.00)%、(91.70±1.39)%,(6.70±0.90)%、(10.03±2.25)%;(2)雌、雄性在其它5个基因的甲基化率均无显着性差异(P>0.05)。驯鹿、梅花鹿血液组织:(1)雌性驯鹿在COL6A3基因的甲基化率显着高于梅花鹿(P<0.05),而在COL1A1、KGF基因的甲基化率显着低于梅花鹿(P<0.05),其在雌性驯鹿、梅花鹿的甲基化率分别是(83.53±2.99)%、(73.50±0.75)%,(3.47±0.61)%、(5.87±0.46)%,(86.70±0.00)%、(90.30±0.52)%;(2)雄性驯鹿仅在OPN基因的甲基化率显着低于梅花鹿(P<0.05),其甲基化率分别为(52.40±0.87)%、(78.07±2.97)%;(3)雌雄性驯鹿、雌性驯鹿与梅花鹿、雄性驯鹿与梅花鹿分别在5个、7个、9个基因的甲基化率均无显着性差异(P>0.05)。雌性驯鹿茸顶端间充质与其血液组织:鹿茸顶端间充质组织在COL1A1、COL6A3、IGF1、KGF、OPN、STAT1基因的甲基化率显着低于其血液组织(P<0.05),在NGF、RUNX1、S100A4基因的甲基化率显着高于其血液组织(P<0.05),其在鹿茸间充质、血液组织的甲基化率分别是(0.00±0.00)%、(3.47±0.61)%,(16.83±1.10)%、(83.53±2.99)%,(0.00±0.00)%、(6.40±0.52)%,(0.00±0.00)%、(86.70±0.00)%,(36.83±5.86)%、(80.00±1.40)%,(0.27±0.12)%、(1.53±0.29)%,(33.90±3.57)%、(27.33±119)%,(3.33±1.44)%、(0.00±0.00)%,(27.80±1.28)%、(6.70±0.90)%。雄性驯鹿茸顶端间充质与其血液组织:(1)鹿茸顶端间充质组织在COL1A1、COL6A3、IGF1、KGF、NGF、OPN、STAT1基因的甲基化率显着低于其血液组织(P<0.05),在S100A4基因的甲基化率显着高于其血液组织(P<0.05),其在鹿茸间充质、血液组织的甲基化率分别是(0.00±0.00)%、(6.40±0.00)%,(6.63±1.31)%、(77.10±4.03)%,(2.23±0.92)%、(7.20±1.28)%,(45.53±3.87)%、(91.70±1.39)%,(17.20±3.57)%(29.23±1.37)%,(18.10±0.87)%、(52.40±0.87)%,(0.20±0.20)%、(1.70±0.20)%,(21.67±2.17)%、(10.03±2.25)%;(2)雌、雄性驯鹿茸顶端间充质与其血液组织分别在9个、8个基因上的甲基化率有显着性差异(P<0.05)。梅花鹿茸顶端间充质与其血液组织:鹿茸顶端间充质组织在COL1A1、COL6A3、IGF1、KGF、NGF、OPN、S100A4、STAT1基因的甲基化率显着低于其血液组织(P<0.05),其在鹿茸间充质、血液的甲基化率分别是(2.40±0.00)%、(5.87±0.46)%,(7.10±1.93)%、(73.50±0.75)%,(0.00±0.00)%、(5.83±1.44)%,(42.20±1.91)%、(90.30±0.52)%,(21.57±1.21)%、(28.57±1.40)%,(35.70±1.40)%、(78.07±2.97)%,(5.03±1.44)%、(8.90±0.52)%,(0.00±0.00)%、(1.40±0.36)%。基因的DNA甲基化水平差异与其所发挥的调控功能差别密切相关。本研究针对鹿茸生长发育调控相关基因DNA甲基化差异的研究结果,为揭示雌雄驯鹿茸间、及其与梅花鹿茸间的表观差异及相关生茸调控机理提供了基础理论积累,同时对进一步开展组织器官再生、损伤修复及肿瘤癌症等一系列人类医学问题的研究具有积极意义。
殷亚杰[9](2018)在《中国驯鹿资源状况及其保护对策》文中研究表明驯鹿(Rangifer tarandus)是我国重要的具有浓郁民族特色的动物,同时也是我国鄂温克族人民独有的经济动物,具有较高的经济价值、观赏价值和学术研究价值。受栖息地、种群和管理等因素的影响,中国驯鹿种群发展持续不前。笔者通过实地调查,详细掌握了我国驯鹿种群的现状,对造成我国驯鹿种群发展缓慢的原因进行了归纳分析,并提出了相应的保护策略。
高希明[10](2018)在《内蒙古根河林业局驯鹿产业现状及未来发展方向》文中研究表明驯鹿是鄂温克民族使鹿文化的重要载体,更是根河地区旅游产业的重要品牌。为培育出优良的中国驯鹿,把驯鹿文化良好的传承下去,给林业局产业发展开辟新路,根河林业局在2017年2月末从芬兰引入了30只驯鹿,把发展驯鹿产业作为富民强企的重要选择。对根河林业局驯鹿养殖现状进行介绍,并对未来发展方向做简要论述,为中国驯鹿产业发展提供了重要理论依据。
二、浅谈中国驯鹿种群(论文开题报告)
(1)论文研究背景及目的
此处内容要求:
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例:
本文主要提出一款精简64位RISC处理器存储管理单元结构并详细分析其设计过程。在该MMU结构中,TLB采用叁个分离的TLB,TLB采用基于内容查找的相联存储器并行查找,支持粗粒度为64KB和细粒度为4KB两种页面大小,采用多级分层页表结构映射地址空间,并详细论述了四级页表转换过程,TLB结构组织等。该MMU结构将作为该处理器存储系统实现的一个重要组成部分。
(2)本文研究方法
调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
三、浅谈中国驯鹿种群(论文提纲范文)
(1)引进芬兰驯鹿体尺指标的测定(论文提纲范文)
1 材料与方法 |
1.1 试验动物 |
1.2 测定项目及方法 |
1.3 体尺指数的计算 |
1.4 数据的统计分析 |
2 结果与分析 |
2.1 体尺数据 |
2.2 体尺指数 |
3 讨论 |
4 结论 |
(2)中国北方驯鹿生物多样性研究与疾病概述(论文提纲范文)
1 基本生物学特征 |
1.1 形态特征与采食 |
1.2 繁殖和迁徙 |
2 种群分布现状 |
3 环境对驯鹿的影响 |
3 .1 气候对驯鹿的影响 |
3.2 寄生虫及疾病对驯鹿的影响 |
3.3 人类行为与驯鹿栖息地保护 |
4 结语 |
(3)雌雄驯鹿茸顶端间充质组织基因转录及表达差异分析(论文提纲范文)
摘要 |
Abstract |
1 绪论 |
1.1 鹿茸的概况 |
1.1.1 鹿茸的组织结构 |
1.1.2 鹿茸的化学成分 |
1.1.3 鹿茸生长发育的规律 |
1.1.4 鹿茸生长发育的影响因素 |
1.2 驯鹿及驯鹿茸 |
1.2.1 驯鹿 |
1.2.2 驯鹿茸 |
1.3 转录组学研究技术 |
1.3.1 RNA-Seq技术 |
1.3.2 RNA-Seq技术在非模式生物中的应用 |
1.3.3 RNA-Seq技术在鹿茸研究中的应用 |
1.4 生物信息学技术对基因的注释 |
1.4.1 生物信息学概述 |
1.4.2 常用生物数据库 |
1.4.3 生物信息学技术对基因的注释策略 |
1.5 实时荧光定量PCR技术 |
1.5.1 实时荧光PCR原理 |
1.5.2 实时荧光PCR的定量原理 |
1.5.3 实时荧光PCR的相对定量2~(-ΔΔCt)法 |
1.6 本研究的目的与意义 |
2 驯鹿茸间充质组织转录组测序及序列组装 |
2.1 试验材料与方法 |
2.1.1 试验材料 |
2.1.2 RNA提取 |
2.1.3 cDNA测序文库构建 |
2.1.4 文库上机测序 |
2.1.5 测序原始数据的分析与检测 |
2.1.6 测序数据的组装 |
2.1.7 文库测序结果质量控制 |
2.2 结果与分析 |
2.2.1 驯鹿茸样品采集结果 |
2.2.2 RNA浓度及质量检测 |
2.2.3 测序数据质量控制 |
2.2.4 测序数据量统计 |
2.2.5 测序数据的De novo组装 |
2.2.6 测序数据与组装结果的比对 |
2.2.7 转录组测序文库质量评估 |
2.3 讨论 |
2.3.1 样品采集 |
2.3.2 转录组测序与组装 |
2.4 本章小结 |
3 驯鹿茸间充质组织基因的功能注释与分析 |
3.1 试验方法 |
3.1.1 基因功能注释 |
3.1.2 基因结构注释 |
3.2 结果与分析 |
3.2.1 蛋白质信息库的注释 |
3.2.2 GO功能分类 |
3.2.3 COG和KOG功能分类 |
3.2.4 KEGG通路分析 |
3.2.5 驯鹿茸生长相关的功能基因筛选 |
3.2.6 基因结构分析 |
3.3 讨论 |
3.3.1 Unigenes的功能注释 |
3.3.2 数据库的功能分类 |
3.3.3 生长发育功能相关基因的筛选 |
3.3.4 基因的结构注释 |
3.4 本章小结 |
4 驯鹿茸间充质组织基因表达量分析及定量验证 |
4.1 试验材料与方法 |
4.1.1 主要试剂 |
4.1.2 主要仪器 |
4.1.3 主要方法 |
4.2 结果与分析 |
4.2.1 高表达基因的筛选 |
4.2.2 高表达基因的功能预测 |
4.2.3 差异表达基因筛选 |
4.2.4 差异表达基因的功能注释 |
4.2.5 差异表达基因GO功能富集分析 |
4.2.6 差异表达基因KEGG通路富集分析 |
4.2.7 驯鹿茸生长相关差异表达基因筛选 |
4.2.8 差异表达基因的相互作用 |
4.2.9 基因表达的RT-qPCR的定量验证 |
4.3 讨论 |
4.3.1 高表达基因的筛选 |
4.3.2 差异表达基因的筛选 |
4.4 本章小结 |
结论 |
参考文献 |
附录 |
攻读学位期间发表的学术论文 |
致谢 |
附件 |
(4)鹿科动物胃内微生物菌群结构及其功能分析(论文提纲范文)
摘要 |
Abstract |
1 绪论 |
1.1 中国鹿科动物分类及分布区域 |
1.1.1 分类地位 |
1.1.2 数量及分布区域 |
1.2 鹿科动物消化系统、食性研究进展 |
1.2.1 鹿科动物食性 |
1.2.2 消化系统形态解剖学 |
1.3 胃内微生物菌群结构研究方法 |
1.3.1 传统方法 |
1.3.2 16S rRNA |
1.3.3 KEGG功能预测 |
1.4 反刍动物胃内微生物菌群多样性研究 |
1.5 反刍动物胃内微生物菌群功能研究 |
1.6 本研究目的意义与内容 |
2 鹿科动物胃内细菌菌群结构与分析 |
2.1 前言 |
2.2 材料与方法 |
2.2.1 实验动物 |
2.2.2 样品处理 |
2.2.3 实验方法 |
2.2.4 16S rRNA文库构建 |
2.2.5 生物信息学分析 |
2.3 结果 |
2.3.1 基本序列数据分析 |
2.3.2 不同鹿科动物胃内细菌菌群差异比对分析 |
2.3.3 同种鹿科动物不同胃内细菌菌群差异比对分析 |
2.3.4 不同鹿科动物同一胃内细菌菌群差异比对分析 |
2.4 讨论 |
2.5 小结 |
3 鹿科动物胃内古菌菌群结构与分析 |
3.1 前言 |
3.2 材料与方法 |
3.2.1 实验动物 |
3.2.2 样品处理 |
3.2.3 实验方法 |
3.2.4 16S rRNA文库构建 |
3.2.5 生物信息学分析 |
3.3 结果 |
3.3.1 基本序列数据分析 |
3.3.2 不同鹿科动物胃内古菌菌群差异比对分析 |
3.3.3 同种鹿科动物不同胃内古菌菌群结构差异比对分析 |
3.3.4 不同鹿科动物同一胃内古菌菌群结构差异比对分析 |
3.4 讨论 |
3.5 小结 |
4 鹿科动物胃内真菌菌群结构与分析 |
4.1 前言 |
4.2 材料与方法 |
4.2.1 实验动物 |
4.2.2 样品处理 |
4.2.3 实验方法 |
4.2.4 生物信息学分析 |
4.3 结果 |
4.3.1 基本序列数据分析 |
4.3.2 不同鹿科动物胃内真菌菌群差异比对分析 |
4.3.3 同种鹿科动物不同胃内真菌菌群结构差异比对分析 |
4.3.4 不同鹿科动物同一胃内真菌菌群结构差异比对分析 |
4.4 讨论 |
4.5 小结 |
5 鹿科动物胃内微生物菌群功能预测分析 |
5.1 前言 |
5.2 材料与方法 |
5.2.1 实验动物 |
5.2.2 测定的指标和方法 |
5.3 结果 |
5.3.1 鹿科动物采食与消化组织形态的协同关系 |
5.3.2 基于宏基因组的鹿科动物胃内菌群功能预测分析 |
5.4 讨论 |
5.5 小结 |
结论 |
参考文献 |
胃内主要菌及相对应的分类地位 |
含显着性分析的GraPhlAn进化树图 |
攻读学位期间发表的学术论文 |
致谢 |
(5)圈养驯鹿粪便中免疫球蛋白含量测定与相关性分析(论文提纲范文)
1 材料与方法 |
1.1 试验动物与分组 |
1.2 主要试剂及仪器 |
1.3 粪样采集及保存 |
1.4 免疫球蛋白提取及测定 |
1.5 数据的统计分析 |
2 结果与分析 |
2.1 不同年龄驯鹿粪便中IgA、IgG和IgM含量比较 |
2.2 雌、雄驯鹿间粪便中IgA、IgG和IgM含量比较 |
2.3 驯鹿粪便中IgA、IgG和IgM含量相关性分析 |
3 讨论 |
4 结论 |
(6)引进驯鹿种群的遗传结构及其多样性分析(论文提纲范文)
摘要 |
Abstract |
1 绪论 |
1.1 驯鹿概况 |
1.1.1 中国驯鹿种群概况 |
1.1.2 驯鹿保护遗传学研究 |
1.2 微卫星遗传标记研究概述 |
1.2.1 微卫星DNA简介 |
1.2.2 微卫星DNA的特点 |
1.2.3 微卫星DNA的分离方法 |
1.2.4 微卫星DNA在遗传分化中的应用 |
1.3 线粒体DNA遗传标记概述 |
1.3.1 线粒体DNA(mitochondria DNA)简介 |
1.3.2 线粒体DNA的遗传特点 |
1.3.3 线粒体DNA D-Loop序列的遗传特点 |
1.3.4 利用线粒体DNA研究的方法 |
1.3.5 线粒体DNA在动物分子进化中的研究 |
1.4 本研究的目的与意义 |
2 材料与方法 |
2.1 实验材料 |
2.1.1 实验样品 |
2.1.2 主要的实验试剂 |
2.1.3 主要的实验仪器 |
2.2 实验方法 |
2.2.1 样品采集 |
2.2.2 DNA的提取及检测 |
2.2.3 微卫星引物的筛选及扩增 |
2.2.4 mtDNA D-Loop序列引物及PCR扩增 |
2.2.5 统计分析 |
3 实验结果 |
3.1 DNA的提取 |
3.2 微卫星位点的筛选 |
3.3 引进驯鹿种群遗传多样性分析 |
3.3.1 微卫星位点上的等位基因分布 |
3.3.2 种群线粒体DNA D-Loop序列文本的测定 |
3.3.3 群体遗传多样性参数的计算 |
3.3.4 多态位点及单核苷酸连锁不平衡 |
3.3.5 单倍型及频率 |
3.3.6 群体有效种群大小 |
3.3.7 群体Hardy-Weinberg平衡及中性检验 |
3.3.8 引进驯鹿种群个体间的遗传距离 |
3.4 引进驯鹿种群与中国种群遗传多样性的比较 |
4 讨论 |
4.1 样品的采集 |
4.2 DNA提取及微卫星位点的选择 |
4.3 引进驯鹿种群的遗传变异分析 |
4.4 引进驯鹿种群的遗传结构 |
4.5 驯鹿引进种群与中国种群的遗传结构差异 |
4.6 对引进驯鹿种群管理的建议 |
结论 |
参考文献 |
附录 |
攻读学位期间发表的学术论文 |
致谢 |
硕士学位论文修改情况确认表 |
(7)鄂温克族驯养驯鹿的本土知识(论文提纲范文)
一、驯鹿的生物特性 |
二、鄂温克驯鹿驯养在我国的分布和发展 |
三、鄂温克族对驯鹿生物属性的认识 |
四、鄂温克驯养驯鹿的技术体系 |
五、驯鹿驯养的生态和社会价值 |
六、小结 |
(8)雌雄驯鹿和梅花鹿茸顶端组织生长调控相关基因DNA甲基化水平差异研究(论文提纲范文)
摘要 |
Abstract |
1 绪论 |
1.1 驯鹿 |
1.1.1 生物学特征 |
1.1.2 中国驯鹿概况 |
1.1.3 驯鹿的研究进展 |
1.2 鹿茸 |
1.2.1 鹿茸顶端的组织结构 |
1.2.2 鹿茸组织发生及再生 |
1.2.3 鹿茸组织骨化及脱落 |
1.2.4 鹿茸的调控机理 |
1.3 研究基因概况 |
1.3.1 COL1A1基因 |
1.3.2 COL6A3基因 |
1.3.3 DKK1基因 |
1.3.4 IGF1基因 |
1.3.5 KGF基因 |
1.3.6 NGF基因 |
1.3.7 OPN基因 |
1.3.8 RUNX1基因 |
1.3.9 S100A4基因 |
1.3.10 STAT1基因 |
1.4 DNA甲基化 |
1.4.1 概述 |
1.4.2 DNA甲基化的检测方法 |
1.4.3 DNA甲基化的生物学意义 |
1.5 本研究的目的与意义 |
2 鹿茸相关基因启动子区克隆及生物信息学分析 |
2.1 实验材料 |
2.1.1 实验样品 |
2.1.2 主要实验试剂 |
2.1.3 主要实验仪器 |
2.1.4 主要生物学软件及相关网站 |
2.2 实验方法 |
2.2.1 样品采集 |
2.2.2 基因组DNA的提取与检测 |
2.2.3 基因启动子区引物设计及合成 |
2.2.4 基因启动子区的扩增及回收纯化 |
2.2.5 T-A克隆及热激转化 |
2.2.6 阳性克隆的鉴定 |
2.2.7 序列的拼接与生物信息学分析 |
2.3 结果 |
2.3.1 基因组DNA的提取 |
2.3.2 克隆引物的合成 |
2.3.3 鹿茸相关基因启动子区的克隆 |
2.3.4 鹿茸相关基因启动子区的生物信息学分析 |
2.4 讨论 |
2.4.1 样品采集及提取 |
2.4.2 基因启动子区的选择 |
2.4.3 鹿茸相关基因启动子区的克隆与分析 |
2.5 本章小结 |
3 驯鹿与梅花鹿茸间充质及血液组织的DNA甲基化模式 |
3.1 实验材料 |
3.1.1 实验样品 |
3.1.2 主要实验试剂 |
3.1.3 主要实验仪器 |
3.1.4 主要生物学软件及相关网站 |
3.2 实验方法 |
3.2.1 样品采集 |
3.2.2 基因组DNA的提取与检测 |
3.2.3 基因组DNA的重亚硫酸盐处理 |
3.2.4 甲基化引物设计及合成 |
3.2.5 甲基化PCR扩增及回收纯化 |
3.2.6 T-A克隆及热激转化 |
3.2.7 阳性克隆的鉴定 |
3.2.8 统计分析 |
3.3 结果 |
3.3.1 基因组DNA的提取 |
3.3.2 甲基化BSP的转化质量 |
3.3.3 甲基化BSP引物设计 |
3.3.4 甲基化BSP扩增及克隆 |
3.3.5 鹿茸间充质、血液组织相关基因的甲基化 |
3.4 讨论 |
3.4.1 亚硫酸氢盐测序 |
3.4.2 鹿茸相关基因的甲基化模式 |
3.5 本章小结 |
4 驯鹿与梅花鹿茸间充质及血液组织的DNA甲基化差异 |
4.1 实验材料 |
4.2 实验方法 |
4.3 结果 |
4.3.1 COL1A1基因的DNA甲基化差异 |
4.3.2 COL6A3基因的DNA甲基化差异 |
4.3.3 DKK1基因的DNA甲基化差异 |
4.3.4 IGF1基因的DNA甲基化差异 |
4.3.5 KGF基因的DNA甲基化差异 |
4.3.6 NGF基因的DNA甲基化差异 |
4.3.7 OPN基因的DNA甲基化差异 |
4.3.8 RUNX1基因的DNA甲基化差异 |
4.3.9 S100A4基因的DNA甲基化差异 |
4.3.10 STAT1基因的DNA甲基化差异 |
4.4 讨论 |
4.4.1 雌雄驯鹿与梅花鹿鹿茸间充质组织之间的DNA甲基化差异 |
4.4.2 雌雄驯鹿与梅花鹿血液组织之间的DNA甲基化差异 |
4.4.3 驯鹿和梅花鹿的鹿茸间充质与血液组织之间的DNA甲基化差异 |
4.5 本章小结 |
结论 |
参考文献 |
攻读学位期间发表的学术论文 |
致谢 |
东北林业大学博士学位论文修改情况确认表 |
(9)中国驯鹿资源状况及其保护对策(论文提纲范文)
1 中国驯鹿种群现状 |
2 中国驯鹿种群发展缓慢因素分析 |
2.1 栖息地面积锐减 |
2.2 种群退化 |
2.3 盗猎严重 |
2.4 兽害频发 |
2.5 管理粗放 |
2.6 环境污染 |
3 保护对策 |
3.1 建立驯鹿生态保护区, 保护栖息地 |
3.2 开展人工饲养, 扩大养殖区域 |
3.3 提高繁殖技术, 引进优良种鹿 |
3.4 加大执法力度, 严打盗猎行为 |
3.5 加大扶持力度, 调动鄂温克养鹿人的积极性 |
3.6 做好宣传教育, 共同保护驯鹿 |
(10)内蒙古根河林业局驯鹿产业现状及未来发展方向(论文提纲范文)
0 引言 |
1 根河林业局地理环境 |
2 养殖现状 |
2.1 现有种群 |
2.2 饲养方式 |
2.3 主要研究 |
2.3.1 食性研究。 |
2.3.2 谱系研究。 |
2.3.3 疾病研究。 |
3 根河林业局驯鹿产业未来发展方向 |
3.1 建立驯鹿种群繁育中心 |
3.2 大力发扬驯鹿文化 |
3.3 深入开发利用驯鹿及其衍生产品 |
3.4 建立国家级驯鹿自然保护区 |
四、浅谈中国驯鹿种群(论文参考文献)
- [1]引进芬兰驯鹿体尺指标的测定[J]. 刘伟石,马希祥,田晓瑞,盖广辉,王庆海,吴晓宇,李和平. 黑龙江动物繁殖, 2021(06)
- [2]中国北方驯鹿生物多样性研究与疾病概述[J]. 张晶钰,张慧敏,李鸿屹,雷林,韩松霖,李和平. 黑龙江畜牧兽医, 2020(17)
- [3]雌雄驯鹿茸顶端间充质组织基因转录及表达差异分析[D]. 毕晓丹. 东北林业大学, 2020(09)
- [4]鹿科动物胃内微生物菌群结构及其功能分析[D]. 王晟楠. 东北林业大学, 2020(01)
- [5]圈养驯鹿粪便中免疫球蛋白含量测定与相关性分析[J]. 殷亚杰,聂春雨,翟健程,张志国,刘伟石,李和平. 黑龙江畜牧兽医, 2019(11)
- [6]引进驯鹿种群的遗传结构及其多样性分析[D]. 韩磊. 东北林业大学, 2019(01)
- [7]鄂温克族驯养驯鹿的本土知识[J]. 林航. 原生态民族文化学刊, 2018(04)
- [8]雌雄驯鹿和梅花鹿茸顶端组织生长调控相关基因DNA甲基化水平差异研究[D]. 翟健程. 东北林业大学, 2019(01)
- [9]中国驯鹿资源状况及其保护对策[J]. 殷亚杰. 黑龙江畜牧兽医, 2018(05)
- [10]内蒙古根河林业局驯鹿产业现状及未来发展方向[J]. 高希明. 农业开发与装备, 2018(02)